Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt39Q6IFX4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt39Q6IFX4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms