Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbno1Q689Z5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbno1Q689Z5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms