Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Arhgef39Q66JY6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgef39Q66JY6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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