Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q66JV7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q66JV7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q66JV7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms