Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp9Q64HY3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sp9Q64HY3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sp9Q64HY3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sp9Q64HY3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Sp9Q64HY3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sp9Q64HY3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp9Q64HY3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms