Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms