Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim24Q64127 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms