Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc18Q640L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
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