Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou4f3Q63955 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms