Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nptx1Q62443 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nptx1Q62443 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms