Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf6Q62311 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms