Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox16Q62247 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms