Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SnrpcQ62241 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms