Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms