Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms