Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3bQ62141 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms