Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd1Q62101 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd1Q62101 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.9 ms