Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prm3Q62100 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prm3Q62100 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Prm3Q62100 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prm3Q62100 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms