Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PtafrQ62035 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtafrQ62035 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PtafrQ62035 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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