Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcbp2Q61990 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcbp2Q61990 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcbp2Q61990 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcbp2Q61990 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms