Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms