Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ecm1Q61508 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ecm1Q61508 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms