Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acvr1bQ61271 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms