Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamb3Q61087 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms