Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms