Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms