Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stip1Q60864 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stip1Q60864 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms