Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms