Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprnQ60673 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprnQ60673 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprnQ60673 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprnQ60673 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprnQ60673 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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