Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2aQ60648 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2aQ60648 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms