Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr1h4Q60641 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms