Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema5bQ60519 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms