Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms