Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsr1Q5SWD9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms