Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggnbp2Q5SV77 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp2Q5SV77 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp2Q5SV77 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms