Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlha9Q5RJB0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms