Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RilpQ5ND29 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RilpQ5ND29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RilpQ5ND29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms