Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf488Q5HZG9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms