Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms