Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms