Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms