Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufaf2Q59J78 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms