Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prss53Q571E5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms