Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prune2Q52KR3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prune2Q52KR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms