Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnl1Q52KE7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms