Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxf2Q4ZGD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms