Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms