Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms