Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms