Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms